Le fleuve Karun, seule voie navigable du pays prend naissance dans les monts du Zagros avant de finir sa course après 850 kilomètres à Khoramshar dans le sud-ouest du pays. Tous les autres cours d'eau du pays sont en général asséchés pendant l'été. Les principaux sont : Sefid roud 795 km
Karkheh 755 km
Qara chai 540 km
Atrak 535 km
Dez 515 km
Hendijan 490 km
Jovein 450 km
Jarahi 438 km
Zayandeh roud 4oo km
Mand 685 km

De très nombreux barrages alimentent les principales villes et fournissent l'eau nécessaire à l'agriculture. Déjà, au temps du roi Shah Abbas, l'eau qui approvisionnait les mosquées et les monuments d?Isfahan était contrôlée par le biais de ponts savamment élaborés, comme le pont Khadju. Le grand bassin aux ablutions qui occupe le centre de la mosquée de l'Imam ou le vaste plan d'eau où se dédouble palais de Chehel Sotoun, le palais aux quarante colonnes, construit par Shah Abbas, tous bénéficient de cet ingénieux système de régulation.

Le plus grand lac d'Iran, le lac d'Ouroumiyeh, d'une superficie totale d?environ 5.000 kilomètres carrés possède une telle salinité que seul un poisson minuscule, l'artémian, arrive à s'y développer. L'Iran est un des principaux producteurs dans le monde de farine d'artémian grâce à ses très nombreux lacs salés, Ouroumiyeh, Daryache Namak, Bakhtegan

Depuis des millénaires, le sud de l?Iran a manqué d?eau. Il y a plus de 4 000 ans Les Perses et les Mèdes, créèrent et développèrent un système de canaux souterrains appelé qanat qui fonctionne toujours. Dans le désert du Lut près de la ville de Yazd des boursouflures dépassent du sol. Il s'agit des puits creusés pour recueillir les eaux souterraines et les acheminer vers les villages et les villes. Creusés à intervalles réguliers, environ tous les cent mètres, faciles d?entretien, les qanats peuvent s'étendre sur plusieurs dizaines de kilomètres et atteindre 300 mètres de profondeur. L?eau s?écoule toute l?année car l?alimentation de ces drains souterrains se fait grâce à la circulation de l?eau contenue dans les sols à forte perméabilité.

La mer Caspienne est de très loin, la mer fermée la plus importante du monde, d?une longueur de plus de 1210 kilomètres du nord au sud et couvrant une superficie d?environ 370.000 kilomètres carrés, de très nombreux fleuves viennent s?y jeter, la Volga, l?Oural, le Zhem. Située à près de 30 mètres sous le niveau de la mer, la mer Caspienne connaît un inquiétant phénomène d?élévation de son niveau d?eau par rapport à celui de la mer, il augmente de plus de 20 centimètres par an. Le seul exemple du petit golfe de Karabogaz gol au Turkménistan en est la preuve la plus flagrante. La mer Caspienne abrite de très nombreuses espèces aquatiques comme l?esturgeon ( beluga, oscietra et sevruga) et le Kilka, sorte de petite sardine qui fait l?objet d?une pêche intensive en raison de sa forte valeur ajoutée sur les marchés d?exportation, en particulier en direction des pays méditerranéens. La société des pêcheries d?Iran (shilat) poursuit une intelligente politique de repeuplement des espèces et ses laboratoires utilisent les meilleures techniques connues pour re-introduire les alevins dans les eaux Iranienne. Malheureusement, le laxisme des autres pays riverains risque de porter un coup mortel au système écologique de la mer Caspienne en raison des multiples rejets incontrôlés.

Le très vaste réseau hydrographique turc s?étend sur un territoire immense où dominent les deux grands fleuves du Proche Orient - le Tigre, avec un cours de 1 718 km), et l?Euphrate, avec 2 330 km - qui prennent source en Turquie. Leur présence occasionne une politique de construction de barrages qui fait de la Turquie le premier producteur d?hydroélectricité de la région.